Основной задачей в деятельности Управления государственной экспертизы Министерства обороны Российской Федерации является проведение государственной экспертизы проектной документации в целях оценки соответствия проектной документации требованиям технических регламентов, санитарно-эпидемиологическим требованиям, требованиям в области охраны окружающей среды, требованиям государственной охраны объектов культурного наследия, требованиям к безопасному использованию атомной энергии, требованиям промышленной безопасности, требованиям к обеспечению надежности и безопасности электроэнергетических систем и объектов электроэнергетики, требованиям антитеррористической защищенности объекта, заданию технического заказчика на проектирование, результатам инженерных изысканий с одновременной проверкой достоверности определения сметной стоимости строительства объектов капитального строительства военной инфраструктуры Вооруженных Сил Российской Федерации.